Ze względu na wiele istotnych funkcji, jakie niezbędne nienasycone kwasy tłuszczowe omega-3 spełniają w organizmie, ich niedobory w pożywieniu mają bardzo istotne konsekwencje zdrowotne.

Kliniczne konsekwencje niedoboru EPA i DHA.

  
1. Stwierdzono, że niedobór DHA może spowodować spowolnienie dojrzewania mózgu i hamować rozwój intelektualny i psychoruchowy dziecka.
  
2. Wykazano, że niedobór DHA może spowodować zaburzenia widzenia u niemowląt i dzieci.
  
3. Przypuszcza się, iż niedobór EPA i DHA w żywieniu kobiet w ciąży stanowić zagrożenie życia dla wcześniaków ze względu  na możliwość wystąpienia niewydolności oddychania spowodowanej niedoborem surfaktantu.
  
4. EPA i DHA odgrywają rolę w regulacji odporności na zakażenia wirusowe i bakteryjne.
  
5. Wstępne badania sugerują, że EPA i DHA mogą mieć wpływ na mechanizmy epigenetyczne niektórych chorób, w szczególności na powstawanie cukrzycy typu I.
  
6. Istnieją  pośrednie  dowody, że  niedobór EPA i DHA w żywieniu dzieci może zwiększać ich nadwrażliwość komórkową na alergeny.